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연구에 따르면 SARS-CoV-2 VOC는 다양한 공간 소스-싱크 역학에 따라 전 세계에 전파됩니다.

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  • Post published:November 30, 2022
  • Post category:Medical

최근에 게시된 연구에서 medRxiv* 프리프린트 서버에서 연구원들은 중증급성호흡기증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2) 변종의 분산 패턴과 글로벌 확장을 평가했습니다.

공부하다: 우려되는 SARS-CoV-2 변종의 글로벌 확장: 항공 여행의 분산 패턴 및 영향. 이미지 제공: RCW.studio/Shutterstock

배경

글로벌 백신 도입 이후, 여행 제한 및 기타 공중 보건 및 사회적 조치(PHSM)가 전 세계 대부분에서 점진적으로 해제되어 여행 및 이동성 추세가 팬데믹 이전 수준으로 회복되었습니다. 여행 제한의 심각성과 범위에도 불구하고 다양한 SARS-CoV-2 변종이 확산되어 전 세계적으로 인기를 얻고 있습니다.

전염병 예방을 위한 대상 여행 제한의 상대적 중요성을 객관적으로 평가하려면 전 세계 및 지역 인간 이동과 관련하여 SARS-CoV-2 우려 변종(VOC)의 전 세계 확산 패턴을 이해하는 것이 필수적입니다.

연구에 대해

현재 연구에서 연구자들은 SARS-CoV-2 VOC의 글로벌 분포 경향을 재구성하기 위해 계통지리학적 및 계통발생학적 기법을 사용했습니다.

각 SARS-CoV-2 VOC의 전 세계 분포 패턴을 정량화하기 위해 팀은 대표적인 샘플 게놈 샘플에서 파생된 날짜가 있는 계통수를 활용하여 개별 공간 위치의 조상 상태를 재구성했습니다. 게놈의 샘플링은 국가 및 변종별 감염 수에 비례하여 수행되었으며 VOC당 약 20,000개의 샘플 게놈의 10개 복제에 대해 테스트가 반복되었습니다. 각 국가 및 대륙에 대한 수입 이벤트와 바이러스 수출 간의 순 차이를 평가하면 대륙 소스 싱크 역학이 나타납니다.

연구팀은 항공 여행이 전 세계적으로 VOC 확산 속도에 어떤 영향을 미쳤는지 알아보기 위해 2020년 2월부터 2022년 3월까지 전 세계 항공 여행 승객 수를 분석한 후 유전 정보를 이용해 VOC를 보고한 국가의 VOC 확산 속도와 비교했다. 이 지연은 발표된 연구에서 각 VOC에 해당하는 가장 최근의 공통 조상(TMRCA)까지의 시간과 각 국가에서 첫 번째 VOC 시퀀싱된 샘플이 수집된 날짜 사이에 관찰된 일수로 측정되었습니다.

전 세계 항공 여행과 글로벌 VOC 분산 지연 간의 상관관계를 조사하기 위해 팀은 각 VOC에 대한 국가별 샘플링 연기와 VOC 분산 동안 해당 국가의 총 입국 여행량과 입국 여행량 간의 쌍별 상관관계를 추정했습니다. 각 VOC에 해당하는 추정 원산지 국가에서.

결과

연구 결과는 각 VOC가 별도의 글로벌 확장 패턴을 가지고 있음을 보여주었습니다. 2020년 11월부터 2020년 12월까지, 2021년 6월부터 2021년 7월까지 SARS-CoV-2 알파, 베타 및 감마 변종이 전 세계적으로 함께 순환하는 것으로 나타났습니다. 영국(United kingdom)은 전 세계적으로 계산된 가장 많은 수출액에 기여했습니다. 팀은 글로벌 확장이 다단계 프로세스로 간주될 수 있다는 점에 주목했습니다. 2020년 말과 2021년 초에 팀은 Alpha가 주로 유럽에 퍼진 다음 유럽에서 아시아 및 아메리카로 퍼질 것으로 예상했습니다.

아프리카에 대한 대부분의 알파 소개는 북미 또는 유럽에서 시작되었으며, 처음에는 서아프리카에서, 더 나아가 동아프리카에서 시작되었습니다. 또한 2021년 2월부터 2021년 5월까지 알파변종이 아시아와 미주 전역에 퍼져 동아프리카에서 아시아로 바이러스 혈통이 교류되는 모습을 보였다.

남아프리카 베타 수출의 약 50%가 같은 지역 내 지역으로 이루어졌습니다. 또한 연구원들은 남부 아프리카에서 서유럽으로, 그리고 나서 서유럽 자체 내에서 상당한 베타 확산을 추론했습니다. 아프리카와 아시아는 2021년 4월 이후에 수출이 최고조에 달하면서 베타의 순 공급원으로 추정되었습니다.

유전적 차이로 인해 Omicron 혈통 BA.1 및 BA.2의 분포 경향은 2022년 3월까지 별도로 확인되었습니다. 2021년 11월부터 12월까지 남부 아프리카에서 발생하여 2020년 12월부터 2021년 3월까지 대규모 감염 파동을 일으켰습니다. 그 후 대부분의 감마 변종은 다른 남미 국가로 옮겨졌습니다.

출현 후 알파, 베타 및 감마 변종은 각각 약 64일에서 425일, 95일에서 300일, 48일에서 251일의 지연으로 국가에서 시퀀싱을 위해 처음 샘플링되었습니다. 평균적으로 국가는 2020년 10월에 출현이 예상된 후 델타 변종을 시퀀싱하는 데 거의 45~336일이 더 필요했습니다.

베타를 제외하고 팀은 총 여행 횟수와 전 세계 국가의 첫 번째 VOC 샘플링 지연 사이에 음의 상당한 연관성을 발견하여 더 많은 여행량과 감소된 VOC 도착 지연 간의 예상되는 관계를 확인했습니다. 또한, 각 VOC를 처음으로 인지한 국가의 여행량과 지연 사이에는 강력한 음의 연관성이 나타났으며, 이는 해당 국가가 해당 국가의 추정된 출발 국가로부터 많은 여행자를 받는 경우 지연이 적은 국가에서 VOC가 나타남을 시사합니다. VOC.

결론

전반적으로 연구 결과는 SARS-CoV-2 VOC가 뚜렷한 소스-싱크 역학에 따라 전 세계적으로 확산되었음을 보여주었습니다. 이 연구는 또한 일반적으로 글로벌 여행 허브가 바이러스 수출에 크게 기여했다고 지적했습니다.

*중요 공지

medRxiv는 동료 검토를 거치지 않은 예비 과학 보고서를 게시하므로 결정적인 것으로 간주하거나 임상 실습/건강 관련 행동을 안내하거나 확립된 정보로 취급해서는 안 됩니다.