You are currently viewing 크라우드소싱이 정밀 의학 프로그램을 발전시키는 방법

크라우드소싱이 정밀 의학 프로그램을 발전시키는 방법

Sarah Prezek은 Booz Allen Hamilton의 수석 동료이자 프로젝트 관리자입니다. 이 블로그는 Booz Allen Hamilton의 수석 과학자인 Vishal Thovarai와 공동 작성되었으며 일레인 요한슨FDA의 데이터, 분석 및 연구실 산하 건강 정보학 담당 이사이자 precisionFDA의 프로그램 관리자입니다.

의료 기관은 정밀 의학의 엄청난 잠재력을 이해하고 있습니다. 현재의 천편일률적인 의료 치료는 균일하지 않은 결과를 제공하며 “평균적인 환자” 건강 프로필에 맞지 않는 사람들에게는 종종 제대로 수행되지 않습니다.

게놈, 환경 및 라이프스타일 정보를 포함하여 개인의 특정 건강 속성을 고려함으로써 의료 전문가는 보다 성공적인 결과를 제공할 특정 치료를 보다 잘 조정할 수 있습니다.

예를 들어 의사가 특정 환자의 고유한 건강 프로필을 기반으로 어떤 COVID-19 백신이 가장 잘 수행되는지 더 잘 이해하거나 장기간 COVID와 관련된 다양한 증상을 해결하는 방법에 대한 통찰력을 얻을 수 있다면 어떨까요?

정밀의학을 입력합니다. 이 분야의 발전으로 이미 강력한 새로운 발견과 사람의 유전적 구성 또는 환자 종양의 유전적 프로필과 같은 특정 특성에 맞는 몇 가지 새로운 치료법이 나오고 있습니다.

많은 암 환자는 이미 환자 치료의 일환으로 일상적으로 분자 검사를 받고 있으므로 의사는 생존 가능성을 높이고 부작용을 최소화하는 치료를 더 잘 맞춤화할 수 있습니다.

그렇다면 정밀 의학 개발자, 규제 기관, 시민 과학자, 연구팀, 소기업 소유자 및 의료 기관은 규제 도구의 안전성과 효능을 보장하는 데 필요한 규제 과학을 어떻게 발전시킬 수 있습니까? 공공 크라우드소싱 과제는 좋은 첫 단계입니다.

정밀 의학 관련 크라우드소싱에 대응하는 다양한 그룹이 달성할 수 있는 고유한 결과가 있습니다. 대체로 크라우드소싱 기반 아웃리치는 대중에게 인식을 높이고 정밀 의학에 대한 참여를 촉진하는 좋은 방법입니다.

공공 크라우드소싱은 또한 정밀 의학 이해관계자 조직(예: 제약 및 생물정보학 회사와 학계) 간의 경쟁을 장려하여 질병의 새로운 유전적 지표와 같은 혁신적인 발견을 제공하고 저렴한 비용으로 신제품 개발로 이어질 수 있는 연구를 가속화할 수 있습니다.

결과적으로 크라우드소싱을 통해 이러한 이해 관계자는 기술을 검증하고 선보일 수 있습니다. 또한 공공 시장용 정밀 의약품의 안전성과 효능을 보장하는 FDA와 같은 규제 기관은 크라우드 소싱을 활용하여 제품 성능을 평가하고 시판 후 감지를 위한 혁신적인 도구 및 방법의 개발을 장려하는 등 정밀 의약품 규제 과학을 발전시킬 수 있습니다. 안전 신호.

정밀 의학에서 크라우드 소싱이란 무엇입니까?

크라우드소싱은 문제나 과제 해결을 목표로 아이디어, 접근 방식, 연구, 전문 지식 및 기타 가치 있는 기여를 제공하기 위해 분산된 대규모 참가자 그룹을 적극적으로 참여시키는 프로세스입니다. 크라우드소싱은 전문가 및 학자로 구성된 글로벌 커뮤니티를 활용하고 이들을 특정 단일 목표로 안내함으로써 과학 및 연구에서 새로운 발견을 촉진하는 데 특히 효과적이며 이는 정밀 의학이라는 획기적인 분야에서 확실히 입증되었습니다. NCTR Indel 호출 Oncopanel 시퀀싱 데이터 챌린지 온코패널 시퀀싱 데이터세트에서 인델을 식별하기 위해 인델 호출 파이프라인을 개발, 검증 및 벤치마킹하도록 참가자에게 요청함으로써 이 아이디어를 구현합니다(PrecisionFDA, 2022).

새로운 과학 분야와 마찬가지로 정밀 의학은 끊임없이 진화하고 있으며 이에 의존하는 기술은 계속해서 빠르게 발전하고 있습니다. 이 환경에서 관련 문제는 많고 복잡합니다. 이러한 문제를 극복하려면 종종 새로운 시각과 다양한 관점이 필요합니다. 이것이 바로 크라우드소싱이 제공하는 것입니다.

그리고 이 분야는 매번 엄청난 발전 가능성이 있는 매우 새롭고 흥미진진하기 때문에 전 세계 과학계에서 진정한 관심과 에너지를 불러일으키고 집단적 에너지와 열정을 생성하여 혁신적인 크라우드소싱 솔루션으로 이어집니다.

전통적으로 과학적 발견은 제품 개발, 임상 시험 및 궁극적으로 제품을 시장에 출시해야 하기 때문에 시간이 많이 걸리고 비용이 많이 듭니다. 크라우드소싱은 이 프로세스를 가속화하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이는 폐쇄형/독점 소프트웨어에 비해 상대적으로 진화가 방해받지 않는 오픈 소스 소프트웨어와 유사한 연구 단계에서 특히 그렇습니다.

과학적 발견을 위한 크라우드소싱의 잠재력 외에도 시간 제한이 있는 이벤트를 통해 상당한 규모의 인재 풀과 전문 지식을 활용할 수 있는 비교적 저렴한 방법을 제공한다는 실용적인 이점도 있습니다.

또한 이 접근 방식은 혁신의 전체 프로세스를 민주화하여 소기업과 학생부터 연구 시설 및 기업에 이르기까지 누구에게나 높은 가시성 과제에서 경쟁하고 자신의 능력을 입증할 수 있는 장소를 제공하여 기회를 증가시킵니다.

마지막으로 크라우드소싱은 직접 경험하는 학습을 보다 쉽게 ​​접근할 수 있는 효율적인 방법입니다. 참가자가 실제 실험이나 연습에서 자신을 테스트할 수 있도록 함으로써 학업과 실제 학습 사이에 종종 존재하는 격차를 해소할 수 있습니다. 이런 식으로 크라우드소싱은 개념적 또는 이론적 아이디어를 실행에 옮기는 훌륭한 도구이며, 이는 우리의 집단적 지식을 더욱 다듬고 발전시킵니다.

크라우드소싱의 실생활 적용

위에서 언급한 바와 같이 크라우드소싱의 실제 사례는 온코패널 시퀀싱 데이터 챌린지의 PrecisionFDA NCTR Indel Calling입니다. 1단계 그리고 2단계. 크라우드소싱이 의사에게 종양에 대한 게놈 수준의 관점을 제공하는 차세대 시퀀싱 도구인 온코패널(oncopanel)의 테스트 및 검증을 지원하는 방법을 고려하십시오. 통찰력은 암 환자에 대한 예측, 예후 및 진단 정보를 개선할 수 있습니다.

oncopanel 기술은 새롭기 때문에 이러한 도구를 확인, 테스트 및 비교하기 위한 벤치마킹 기술이 거의 없습니다. 이 과제는 oncopanel 규제 과학을 발전시킬 수 있는 벤치마킹 알고리즘과 접근 방식을 고안하는 데 도움이 되도록 정밀 의학, 종양학 및 차세대 시퀀싱 커뮤니티를 요구하고 있습니다.

이 과제의 한 가지 특정 차원은 특정 뉴클레오티드 서열이 존재하거나(삽입) 부재(결실)하는 유전적 변이 유형인 삽입/결실 돌연변이 또는 “인델”을 식별할 수 있다는 것입니다.

인델은 종종 암 세포의 형성과 연관되기 때문에 게놈 서열 내에서 인델을 식별하는 것이 중요합니다. 이것은 일반적인 차세대 시퀀싱 문제이며 크라우드소싱을 통해 온코패널 및 차세대 시퀀싱을 전문으로 하는 전문가 커뮤니티가 이를 해결할 수 있는 알고리즘을 제안할 수 있습니다.

전 세계에 이미 이 작업을 수행하고 있는 실험실이 있으며 솔루션을 시연, 평가 또는 검증하여 개발 중인 다른 솔루션과 비교하는 방법을 확인할 수 있는 기회를 환영합니다. 크라우드소싱을 통해 연구 센터는 해당 분야의 주요 연구원 커뮤니티 중에서 최고 성능의 인델 호출 파이프라인을 평가하고 식별할 수 있습니다.

정밀 의학 개발자, 규제 기관, 시민 과학자, 연구팀, 소기업 소유주 및 의료 기관은 크라우드 소싱을 정밀 의학 프로그램의 보다 통합되고 중요한 부분으로 만드는 데 관심이 있다면 지금 조치를 취할 수 있고 해야 합니다. 다음 단계로 다음을 고려하십시오.

  • 챌린지 프레임워크로 호스트 플랫폼 및 환경 보호

  • 커뮤니케이션 전략 및 거버넌스를 포함하여 아이디어에서 최고 성과자 발표까지의 방법론

  • 프로그램/프로젝트 관리자, 그래픽 및 커뮤니케이션 지원, 데이터 과학자를 포함한 다양한 구성 팀

  • 주요 문제 및 사용 가능한 데이터(해당하는 경우)가 있는 파트너 또는 내부 담당자는 문제를 평가하고 사용할 수 있습니다.

크라우드소싱을 정밀 의학 프로그램에 제도화함으로써 정밀 의학 개발자, 규제 기관, 시민 과학자, 연구팀, 소기업 소유주 및 의료 기관과 같은 이해 관계자는 빠르게 부상하는 이 분야의 많은 과제를 해결하기 위한 사고와 접근 방식의 시야를 극적으로 넓힐 수 있습니다. 과학 기술의.